Metropolis’un ışıltılı ve hareketli caddelerinde, Lois Lane ve Jimmy Olson, gökyüzünde beliren bir gizemle yüzleşirken, şehrin kalbinde bir tehlike sezerler. Adalet Birliği’nin ansızın ve gizemli bir şekilde ortadan kaybolmasının ardından, şehirde bir belirsizlik ve karmaşa hüküm sürer. Bu muamma dolu durumu aydınlatmak için Adalet Salonu’na doğru hızla ilerlerler ancak araştırmaları, ansızın ortaya çıkan bir hayaletin gizemli çıkışıyla sekteye uğrar ve korkutucu bir takip başlar. Korku dolu anlarda, çaresizlik içinde, Lois ve Jimmy, yardım için en güvenilir ekibe, yani Mystery Incorporated’a başvurur. Ekip, aceleyle Metropolis’e doğru yola çıkar. Ancak yolda, şehrin Justice League’in yokluğunda süper kötüler tarafından ele geçirildiğini öğrenirler. Bu karanlık gelişme karşısında Lois ve Jimmy’nin tek sığınakları Daily Planet olur. Sonunda güvenli limanlarına varan ikili, durumu açıklamak için Mystery Incorporated ile buluşur. Birlikte, Adalet Salonu’nda derinlemesine bir araştırmaya koyulurlar. Ancak beklenmedik bir sürprizle karşılaşırlar: Lex Luthor, Mercy Graves ve hatta Luthor’un sadık köpeği Rex. Şimdi, bu karmaşık olayları çözmek için, Mystery Incorporated ve Lois ile Jimmy, Krypto adında güçlü bir süper köpek ile güçlerini birleştirmek zorundadırlar. Adalet Birliği’nin kayboluşunun perdesini aralamak için zorlu bir mücadeleye girişirler.