1982 yılında, evrenin derinliklerinde son bir umutla hayatta kalmayı başaran bir grup uzaylı, Dünya’ya iniş yapar. Güney Afrika’nın sessiz ve izole bir bölgesine yerleşen bu varlıklar, burada yeni bir başlangıç yapmayı planlarlar. Ancak, MNU adında hırslı bir şirket, bu yabancıların varlığını fark eder etmez onları hedef alır. Şirket, uzaylıların ileri teknolojisini ele geçirmek ve bu sayede büyük kazançlar elde etmek için harekete geçer. Bu amaçla uzaylıları District 9 adını verdikleri bir bölgeye hapsederler. Ancak MNU’nun planları, sıradan bir çalışan olan Wikus van der Merwe’nin beklenmedik bir şekilde bir virüse maruz kalmasıyla bozulur. Merwe, yavaş yavaş bir uzaylıya dönüşmeye başlar ve bu durum, onu hem MNU’nun hem de insanlığın hedefi haline getirir. Artık ne insan ne de tamamen bir uzaylı olan Merwe, hayatta kalmak için tek bir çare bulur: District 9’a sığınmak. Orada, yeni formuna alışmaya çalışırken, aynı zamanda MNU’nun acımasız planlarına karşı direnişe geçer. Bu süreçte, hem kendi hayatını koruma hem de uzaylıların geleceğini şekillendirme mücadelesi verir. Merwe, sadece bir hayatta kalma savaşı değil, aynı zamanda bir direniş hareketinin de öncüsü haline gelir.